Gracias a esa buena campaña Atlético Argentino disputó el primer certamen del Torneo Argentino B, en el cual consigue 5 victorias, 2 empates y 2 derrotas. El 23 de octubre de 2022, los ahora dirigidos por Hugo Ibarra, se consagran campeones de la Liga Profesional de Fútbol Argentino tras empatar 2-2 con Independiente en la última fecha, superando a Racing Club por 2 unidades. El 6 de noviembre de 2022, el conjunto boquense pierde la final del Trofeo de Campeones de la Liga Profesional, ante Racing Club por 2-1 (que disputó esta copa por ser subcampeón de la Liga Profesional, y tras haberle ganado un partido de desempate a Tigre, subcampeón de la Copa de la Liga). Al final, en un partido muy emotivo, y gracias a un gol de Carlos Tévez acabaría en victoria 1-0 y el empate de River ante Atlético por 1-1 le daría el título al equipo Xeneize sumando así su título número 69 y el segundo del ciclo de Russo.

Dos meses más tarde, se confirmó que Fernando Gago abandonaría el club xeneize tras la rotura del tendón de Aquiles sufrida en su último partido. El equipo de Russo finalizó 2° en su zona a 9 puntos del líder Vélez, por lo que tuvo que enfrentar en la siguiente fase al 3° de la zona A, o sea, su clásico River Plate. En el ámbito local, Boca disputó la final de la Copa de la Liga Profesional de Fútbol de AFA 2020, renombrada como, Copa Maradona contra Banfield, tras salir primero en las dos zonas que jugó, donde enfrentó a Lanús, Newell’s y Talleres (Primera fase) y en la Fase Campeonato a Arsenal, Argentinos, Independiente, River y Huracán. En marzo de 2020 Boca llegaba segundo con 45 puntos a la última fecha de la Superliga Argentina 2019-20 luego de golear a Colón por 4-0 y debía jugar con Gimnasia y Esgrima La Plata (dirigido en ese momento por Diego Maradona) al mismo tiempo que River puntero en el campeonato, quién había empatado con Defensa y Justicia por 1-1 con 46 puntos debía jugar contra Atlético Tucumán; un empate o derrota del millonario lo dejaba con el título siempre y cuando derrote a Gimnasia mientras que una victoria de River declararía campeón al club de Núñez.

Después de esta dura derrota, recibiría a Lanús con público en la Bombonera después de 578 días (a causa de la pandemia del Covid 19), en un partido que terminó ganando 4 a 2. Dos semanas después, pierde dos partidos seguidos ante Vélez Sarsfield y Gimnasia y Esgrima de La Plata. Finalizó 2° en el grupo tras empatar con Barcelona y golear a The Strongest, ambos partidos en la Bombonera. En la Copa Libertadores 2021, Boca compartió el grupo C con Santos, Barcelona de Guayaquil y The Strongest. Aunque tuvo un buen comienzo con victorias frente a The Strongest en La Paz y contra Santos en Buenos Aires, luego sufrió dos derrotas consecutivas en Guayaquil y en Vila Belmiro. Boca debutó en la Libertadores el 5 de abril de ese mismo año, siendo derrotado en Palmira por Deportivo Cali (2:0), posterior a esto recibió a Always Ready en Buenos Aires, el partido finalizó 2:0 a favor del equipo de La Ribera. En junio de ese mismo año, se enfrentó con Corinthians, nuevamente, esta vez por los octavos de final de la Copa Libertadores 2022. El primer partido en el estadio Neo Química Arena finalizó 0:0. En la vuelta en Buenos Aires, el partido también finalizó 0:0, en medio del encuentro Darío Benedetto erró un penal.

En cuartos de final enfrentó a Racing (quién eliminó al vigente campeón Flamengo por penales 5-3 luego de empatar en el global 2-2), camiseta del valencia nueva tras haber perdido por 1-0 de visitante en el Cilindro de Avellaneda ganó por 2-0 con goles de Salvio y Villa de penal en La Bombonera y clasificó a semifinales en donde enfrentó al Santos. Tras haber ganado 1-0 con gol del apache Carlos Tévez y haber perdido 1-0 en el partido de vuelta en La Bombonera jugando un flojo partido en dónde Frank Fabra anotó en contra el único gol del partido, Boca se clasificó tras ganar por penales 5-4. Edwin Cardona falló un penal y convirtieron Tévez, Eduardo Salvio, Fabra, Carlos Izquierdoz y Leonardo Jara. Afuera de la Libertadores, Boca sólo pudo competir en la Copa Argentina y el torneo local. Inicialmente Boca se negó a jugar la revancha y solicitó la descalificación de River, pero la CONMEBOL rechazó la solicitud (a pesar de lo sucedido en los octavos de final de la Copa Libertadores 2015) y ordenó jugar el partido en Europa, el 9 de diciembre en el estadio Santiago Bernabéu, donde Boca perdió por 3 a 1 en tiempo suplementario tras quedarse con dos jugadores menos por la expulsión del mediocampista Wilmar Barrios y la desafortunada lesión de Fernando Gago (el DT ya había agotado los cambios permitidos).